PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R


Tous les programmes présentés ici sont des logiciels libres et gratuits.

Les utilisateurs ont la liberté d'exécuter, copier, distribuer, étudier, modifier et améliorer ces logiciels.

Nous défendons ces libertés parce que chacun les mérite. Avec ces libertés, les utilisateurs (à la fois individuellement et collectivement) contrôlent le programme et ce qu'il fait pour eux. A l'inverse un programme non libre contrôle les utilisateurs et son développeur le contrôle. Le programme devient donc l'instrument d'un pouvoir injuste.

Qu'est-ce que le logiciel libre?

Auteurs

Bruno Lecoutre Bruno LECOUTRE   Jacques Poitevineau Jacques POITEVINEAU


PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R



PAC (Programme d'Analyse des Comparaisons) est un programme général d'analyse de variance univariée et multivariée.

C'est un outil unique, utilisable aussi bien pour une initiation au traitement des données expérimentales que pour des applications sophistiquées. C'est un programme général puissant d'analyse de variance univariée et multivariée, incluant l'analyse de covariance, l'analyse de la régression polynômiale et l'analyse discriminante.

Il est particulièrement adapté aux plans à mesures répétées, avec des effectifs de groupes égaux ou inégaux.

Un puissant langage de demandes de comparaisons permet à l'utilisateur, en fonction de ses questions, de sélectionner les effets à analyser: effets principaux, d'interaction, partiels, conditionnels, intra, associés aux composantes de la régression polynômiale...

PAC effectue des analyses univariées et multivariées, descriptives et inférentielles, détaillées. Ces analyses englobent les procédures traditionnelles (tests de signification) et les prolongent, d'une part en permettant d'abandonner les suppositions habituelles d'égalité des variances-covariances, et d'autre part en apportant des conclusions sur l'importance réelle des effets (notamment dans le cadre de l'inférence bayésienne).
PAC a été conçu dans les années 1980 par Jacques Poitevineau, en collaboration avec Bruno Lecoutre pour la partie statistique proprement dite. Il a été écrit par Jacques Poitevineau dans la norme FORTRAN 90. Les sous-programmes sont originaux, à l'exception de quelques-uns qui proviennent des bibliothèques LINPACK/EISPACK, et de certaines fonctions mathématiques. comme betacdf. f90 (lorsque c'est le cas, l'origine est indiquée par des commentaires dans la source).

A l'origine PAC avait été conçu pour être exécuté seul sur la plupart des plates-formes en mode console.

PAC comprend deux sous-ensembles principaux:
1) Le sous-ensemble GMP (pour Groupe Mathématiques et Psychologie). Le but des sous-programmes de ce sous-ensemble est le traitement général des données (combien de variables, leurs caractéristiques), quels sont les noms à donner aux variables, le nom du fichier de données d'entrée, etc.
2) Le sous-ensemble PAC qui effectue les analyses statistiques.

Chacun de ces sous-ensembles utilise la boîte à outils ANACOM7 (ANAlyse des COMmandes) pour l'analyse des commandes de l'utilisateur. La structure et la syntaxe de ces commandes, ainsi que certains aspects de l'organisation du programme, ont été inspirés du logiciel BMDP.


PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R


Le P A C   Version 2.0
LePAC était à l'origine une interface Windows conviviale pour exécuter le programme PAC.

D'autres programmes ont été progressivement inclus:

LesMoyennes permet de mettre en oeuvre de manière simple et interactive les procédures bayésiennes pour des problèmes de comparaison de moyenne. Il inclut les procédures fréquentistes usuelles, tests de signification et intervalles de confiance.

Il effectue également des inférences exactes pour un coefficient de corrélation: Tests (hypothèse nulle ρ=0 ou ρ=ρ0≠0), intervalles de confiance, Procédures fiducio-bayésiennes.

LesEffectifs effectue le calcul de probabilités prédictives bayésiennes et intègre la la puissance fréquentiste traditionnelle comme cas particulier.

LesEchantillons effectue des tirages d'échantillons et simulations des distributions d'échantillonnage pour les statistiques descriptives et inférentielles dans le cas d'un ou deux échantillons de distributions parentes normales.

LesProportions effectue des inférences bayésiennes sur des proportions.

LeB-A-Bayésien a une vocation didactique pour comprendre le B-A-BA de l'inférence bayésienne à partir de situations de base.

LesDistributions permet d'obtenir à la fois les courbes de la densité, les fonctions de répartition directe et inverses, les fonction de hasard (y compris cumulées), ainsi que les énoncés de probabilité correspondant aux fonctions de répartition directe et inverse. Un grand nombre de distributions continues et discrètes sont disponibles, avec des transformations pour les distributions continues et la possibilité de troncature inférieure ('à gauche') et supérieure ('à droite').

LePrep peut être utilisé à partir d'un test t de Student ou d'un test F de l'analyse de variance à un degré de liberté pour obtenir la probabilité prédictive prep (''Killeen's probability of replication") de trouver un effet de même signe dans une réplique.
LePAC a été écrit en Visual Basic par Bruno Lecoutre. De nombreuses fonctions, ont été parallèlement écrites en FORTRAN par Jacques Poitevineau.
Pour en savoir plus
sur LePAC

PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R


LePrep "Probabilities of replication"   

LePrep est un version indépendante du programme inclus dans LePAC. Il peut être aussi utilisé comme une macro Word.
Calcul de prep de Killeen, de psrep et de preprep
Estimation par intervalles pour un contraste: effet standardisé (calibré) ou brut
Distribution K-prime (cas particuliers: t non-centré et Lambda-prime)

 Lecoutre B., Lecoutre M.-P., Poitevineau J. (2010) - Killeen’s probability of replication and predictive probabilities: How to compute, use and interpret them. Psychological Methods, 15, 158-171.

Pour en savoir plus
sur LePrep

PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R


Distributions statistiques
                   pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
                   Fonctions FORTRAN


Des programmes en FORTRAN sont plus particulièrement consacrés aux distributions statistiques pour l'inférence bayésienne. Ils donnent notammment les fonctions de répartition des distributions introduites pour l'analyse bayésienne des comparaisons: Psi-deux, Lambda-prime, Lambda-deux, K-prime et K-deux.

Lecoutre B., Guigues J.-L., Poitevineau J. (1992) - Distribution of quadratic forms of multivariate Student variables. Applied Statistics, 41, 617-627.
Lecoutre B. (1999) - Two useful distributions for Bayesian predictive procedures under normal models. Journal of Statistical Planning and Inference, 77, 93-105.
Poitevineau J., Lecoutre B. (2010) - Implementing Bayesian predictive procedures: The K-prime and K-square distributions. Computational Statistics & Data Analysis, 54, 723-730.

Télécharger
Poitevineau J., Lecoutre B. (2010) - Statistical distributions for Bayesian experimental data analysis, FORTRAN functions: 1. Continuous distributions. ERIS.
Poitevineau J., Lecoutre B. (2010) - Statistical distributions for Bayesian experimental data analysis, FORTRAN functions: 2. Discrete distributions. ERIS.
Poitevineau J., Lecoutre B. (2010) - Statistical distributions for Bayesian experimental data analysis, FORTRAN functions: 3. Miscelleanous. ERIS.
Télécharger
les fichiers FORTRAN (fichier ZIP)

PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R


Intervalle de confiance exact de Blaker

Des programmes en FORTRAN et en R permettent de calculer l'intervalle de confiance exact de Blaker pour une proportion pour une distribution parente:
Binomiale
Binomiale négative
Poisson
Hypergéométrique

 Lecoutre B., Poitevineau J. (2016) - New Results for Computing Blaker's Exact Confidence Interval for One Parameter Discrete Distributions. Communications in Statistics Simulation and Computation, 45, 1041-1053.

Télécharger
le code source FORTRAN (fichier ZIP)
Télécharger
le code source R (fichier ZIP)


PAC
Programme d'Analyse des Comparaisons
Source FORTRAN
LePAC
Logiciel WINDOWS
LePrep
Logiciel WINDOWS
Macro WORD
Distributions statistiques
pour l'analyse bayésienne des données expérimentales
Fonctions FORTRAN
Intervalle de confiance de Blaker
Source FORTRAN
Source R